济宁制药设备在生产药品时会出现一些原辅料和微生物的残留，在一定合适温度下会利用设备中残留的辅料作为有机物营养并进行大量繁殖，再留下代谢产物，这些物质的参合将会直接产生较大的毒副作用。

济宁制药设备的清洗需要根据具体情况，确定可操作的清洗方法，要根据不同的清洗方法，通过测定微生物限度和总有机碳确定残留污染物的限度。

济宁制药设备在清洗时可以先冲洗，在用碱洗，再冲洗。碱洗可以除油污、生物膜。对设备清洗效果很好，一般氢氧化钠就行，而且便宜，操作对人员操作危害相对小，易操作。

济宁制药设备的清洗使用淋洗法进行清洗验证的，相应的残留物检查，采集淋洗液作为检查试样测定总有机碳。